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TARGET VALIDATION

靶点可降解性评估

TPD 项目的入口:用表达定位、蛋白周转、热稳定与功能依赖性等读出,判断一个靶点值不值得做、能不能被降解,给出可解释的结论与策略建议,而不是默认它可成药、可降解。

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评估内容与对应技术

按评估维度分组,每一项都对应可执行的读出方法与它能回答的问题。

判断维度

先回答三个问题

把“能不能做”拆成可分别回答的判断。

  • 靶点生物学相关性 — 它在你关心的生物学背景里是否真的参与
  • 靶点可降解性 — 蛋白能否被泛素-蛋白酶体系统有效清除
  • 靶点治疗潜力 — 降解它是否带来可观测的功能后果
表达与定位

表达水平与亚细胞定位

先确认靶蛋白在体系里真实表达、定位在哪。

  • qPCR — mRNA 表达水平定量
  • Western Blot — 蛋白表达水平检测
  • IF 免疫荧光 — 蛋白表达与亚细胞定位
  • IHC — 组织层面表达分布(协作平台执行,我们负责方案与读出)
稳定性与周转

蛋白半衰期与周转

蛋白本底周转特征,直接关系到可降解性。

  • Protein t1/2 assay — 靶蛋白基础半衰期测定
  • CHX chase — 翻译阻断下的蛋白周转速率
热稳定与细胞内结合

热位移验证

确认配体对靶点的结合与稳定作用。

  • TSA — 体外热稳定位移检测
  • CETSA — 细胞内靶点结合与热稳定验证
功能依赖性

细胞是否真的依赖它

用遗传扰动验证靶点的功能必要性。

  • CRISPR/Cas9 KO — 敲除后看表型是否依赖该靶点
  • RNAi 敲低 — 降低表达看功能依赖
  • 过表达 — 增益效应验证
  • 突变引入 — 关键结构域 / 位点的功能依赖
功能读出

把依赖性落到可量化读出

将靶点扰动连接到具体的细胞表型。

  • 细胞活力 / 增殖 — 功能后果量化
  • 信号通路 / 报告基因 — 通路活性变化
02

你需要提供

材料越完整,评估越准;缺少的部分我们会先做一次可行性沟通再确定范围。

  • 靶点信息 — 靶点名称、亚型、物种来源,以及你关心的生物学问题。
  • 结构 / 序列 — 可用的蛋白结构、PDB 编号或序列信息(有则更准,没有也可推进)。
  • 已有化合物 — 已知活性分子、工具化合物或拟用的 E3 配体(结构式 / SMILES)。
  • 科学问题与目标 — 你想验证什么、计划走 PROTAC 还是分子胶、预期的下一步。
03

你会拿到

一份能支撑决策的评估结论,而不只是一堆原始数据。

  • 可降解性判断 — 结合表达、周转与结合证据,给出靶点是否适合降解策略的判断。
  • 功能依赖性证据 — 遗传扰动与功能读出的结果,说明细胞对该靶点的依赖程度。
  • 策略建议 — 若适合降解,建议优先的 E3 体系与切入模块;若不适合,如实说明原因。
  • 原始数据与报告 — 实验方法、对照设置与可追溯的原始数据,结论可复核。

想先评估一个靶点
能不能做降解?

把靶点和你的科学问题发给我们,先做一次务实的可行性沟通。