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MOLECULAR GLUE DISCOVERY

分子胶筛选
与底物发现

围绕 CRBN 分子胶体系,做分子胶降解剂筛选、已知/未知底物发现与选择性分析;可按你的需要走降解优先或 E3 优先,最后给出降解读出与可解释的结论。

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技术清单与对应读出

按子领域分组,每一项都写清它测什么、给什么,可扫读、可按需组合。

分子胶降解筛选

从小分子到降解信号

用 CRBN 体系筛能诱导靶蛋白降解的小分子,可两条路径切入。

  • CRBN 分子胶降解剂筛选 — 在 CRBN 体系下筛出能诱导靶蛋白降解的小分子
  • DCAF15/DDB1/CUL4 相关分子胶评价 — 评估化合物对 DCAF15/DDB1/CUL4 这条招募轴的依赖
  • 降解优先 screening — 先看靶蛋白是否真的下降,再回溯机制
  • E3 优先 screening — 先看小分子与 E3 的结合及对底物的招募,再看降解
  • 小分子库筛选 — 在化合物库规模上跑降解读出,找出有降解活性的 hit
  • DEL hit 后生物学验证 — 对 DEL 筛出的 hit 做细胞内降解与机制确认
  • ASMS hit 后生物学验证 — 对 ASMS 筛出的 hit 做生物学验证,确认是否经分子胶机制
底物发现与验证

到底招募并降解了谁

确认分子胶招募的是已知底物还是新的未知底物,并验证 PPI。

  • 已知底物分子胶筛选 — 针对 GSPT1、IKZF1/3、CK1α、RBM39 等已知底物,筛能诱导其降解的分子胶
  • 未知底物分子胶筛选 — 在底物未知的情况下,找出分子胶实际诱导降解的蛋白
  • 分子胶诱导 PPI 验证 — 验证小分子是否真的把靶蛋白与 E3 拉到一起
  • neosubstrate validation — 确认候选 neosubstrate 是分子胶依赖的真实底物,而非假阳性
选择性与脱靶

专一降解还是连带脱靶

看这枚分子胶是只降一个底物,还是连带降了一串。

  • 分子胶底物谱分析 — 给出该分子胶诱导降解的底物范围(大规模质谱由协作平台执行)
  • 分子胶选择性分析 — 量化它在目标底物与其他蛋白之间的选择性
  • 分子胶脱靶底物发现 — 找出目标之外被一并降解的脱靶底物(深度脱靶质谱由协作平台执行)
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你需要提供

材料越完整,路径定得越准;缺少的部分我们会先做一次可行性沟通再确定范围。

  • 化合物与结构 — 候选分子胶或 hit 的结构式 / SMILES、纯度与溶解条件,以及来源(DEL、ASMS 或其它)。
  • 靶点 / 底物方向 — 你关心的靶蛋白或底物,是 GSPT1、IKZF1/3、CK1α、RBM39 等已知底物,还是底物未知。
  • 已有数据 — 已有的活性、结合或筛选数据,以及你已经做过的验证(有则更快,没有也可推进)。
  • 目标与路径偏好 — 你想回答的科学问题、计划走降解优先还是 E3 优先,以及预期的下一步。
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你会拿到

一份能支撑决策的降解与底物结论,而不只是一堆原始数据。

  • 降解读出结论 — 靶蛋白是否被诱导降解、是否经 CRBN 走分子胶机制的明确判断与数据。
  • 底物招募结果 — 已知/未知底物的发现结果,以及分子胶诱导 PPI 与 neosubstrate 的验证结论。
  • 选择性与脱靶判断 — 分子胶底物谱与选择性分析结果,以及脱靶底物的初步判断与建议。
  • 原始数据与方案建议 — 实验方法、对照设置与可追溯的原始数据,结论可复核,并附后续优化方向。
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常见问题

分子胶筛选和 PROTAC 筛选有什么不同?
分子胶多为单价小分子,靠诱导 E3 与底物形成新界面(molecular glue)促降解,没有现成的双功能结构可依赖,因此更看重直接的细胞内降解读出与底物发现;我们以 CRBN 体系为特色,可走降解优先或 E3 优先两条路径。
底物未知、只有化合物,能筛出它降解了谁吗?
可以。未知底物分子胶筛选正是在底物未知时,找出分子胶实际诱导降解的蛋白,并通过 PPI 与 neosubstrate 验证确认是分子胶依赖的真实底物,而非假阳性。
怎么确认降解是经 CRBN / 分子胶机制,而不是别的原因?
通过 DCAF15/DDB1/CUL4 招募轴依赖性评价,以及分子胶诱导 PPI 验证,判断化合物是否真的把靶蛋白与 E3 拉到一起,再结合降解读出确认走的是分子胶机制。
DEL / ASMS 筛出的 hit,可以接着做生物学验证吗?
可以。我们对 DEL 或 ASMS 筛出的 hit 做细胞内降解与机制确认,判断其是否经分子胶机制起效,把亲和/富集层面的 hit 落到真实的降解证据上。
能评估分子胶的选择性和脱靶吗?
可以做分子胶底物谱与选择性分析、脱靶底物发现,量化它在目标底物与其他蛋白间的选择性;其中大规模、深度脱靶质谱由具备资质的协作平台执行,我们负责设计、细胞内验证与数据整合。

把你的分子胶 hit
交给我们看一看

先聊清楚分子、靶点与目标,再一起定降解优先还是 E3 优先的路径;需要先确认结合或机制时,可衔接结合与三元复合物、降解机制确证模块。