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CELL FUNCTION & PATHWAY READOUTS

细胞功能与通路评价

在确认降解之外,看清降解带来的功能与表型后果——细胞内靶点占有、通路验证、活力表型与原代/免疫功能,让你判断分子是否真的产生预期生物学效应。

01

可选读出

按子领域分组,每项写清测什么;按你的靶点与机制问题挑选组合。

细胞内靶点占有与互作

确认分子在活细胞里真的结合到靶点、形成复合物

不止看蛋白降没降,也看占有与相互作用是否成立。

  • NanoBRET target engagement — 活细胞内测化合物对靶点的占有与亲和
  • NanoBRET/NanoBiT PPI — 活细胞内读出蛋白-蛋白相互作用的形成或破坏
  • CETSA/thermal shift in cells — 用热稳定位移确认细胞内靶点结合
  • AlphaLISA/HTRF cell-based — 均相方式定量细胞内互作或下游标志物
  • 细胞内二元/三元复合物验证 — 确认降解剂诱导的靶点-E3 三元复合物在细胞内成立
  • Live-cell target engagement — 实时追踪占有动力学,看结合的快慢与可逆性
细胞活力与表型

看降解是否带来活力、增殖与命运层面的后果

从单点活力到高内涵表型,量化分子对细胞的整体影响。

  • 细胞活力(CellTiter-Glo、CCK-8、MTT) — 测处理后存活细胞量,给出 IC50/活力曲线
  • 增殖 — 测细胞群体的生长速率变化
  • 癌细胞 panel — 在多株细胞系上比较敏感性谱
  • 2D/3D 模型 — 在贴壁与球体/类器官模型中评价表型
  • 克隆形成 — 测长期增殖与存活能力
  • 细胞周期(PI flow、EdU/BrdU) — 测各周期时相分布与 DNA 合成
  • 凋亡(Annexin V/PI、Caspase、cleaved PARP、TUNEL) — 多标志物确认程序性死亡
  • LDH release — 测细胞膜破损反映坏死/毒性
  • 迁移/侵袭 — 测细胞运动与穿膜侵袭能力
  • HCA 高内涵成像 — 单细胞层面同时读多个形态与标志物参数
  • 药物协同 — 测联用下的协同/拮抗关系
  • 耐药模型 — 在耐药细胞上评价分子是否仍有效
信号通路与报告基因

验证降解是否落到目标通路上

把靶点变化连到下游通路活性与基因表达。

  • Reporter gene(STAT、NF-κB、Wnt/β-catenin、AP-1、HIF) — 用报告基因读出通路活性变化
  • qPCR 下游基因 — 测目标通路下游基因的转录响应
  • WB/Jess 通路蛋白 — 检测关键通路蛋白的表达水平
  • 磷酸化蛋白检测 — 读出信号节点的磷酸化激活状态
  • 细胞因子释放 — 测处理后分泌型细胞因子的变化
  • pathway rescue — 用回补实验确认表型与目标通路的因果关系
原代与免疫功能

对分子胶与免疫炎症靶点尤其重要的功能读出

在原代与免疫细胞上验证降解的功能后果,更贴近生理。

  • PBMC/原代 T 细胞/原代 B 细胞降解检测 — 在原代免疫细胞中确认靶点降解
  • Jurkat/Ramos/OCI-LY10 模型 — 在免疫相关细胞系中建立功能读出
  • T/B 细胞活化 — 测刺激后淋巴细胞的活化响应
  • CD69/CD25 流式 — 用活化标志物流式定量活化程度
  • 细胞因子(IL-2/IL-6/IL-17A/TNF-α/IFN-γ) — 测分泌细胞因子谱反映免疫功能
  • Th17 分化 — 评价分子对 Th17 极化的影响
  • T/B 细胞增殖 — 测淋巴细胞在刺激下的增殖能力
  • MLR — 用混合淋巴细胞反应评价免疫调节作用
  • ADCC/ADCP/CDC — 测抗体依赖/补体依赖的效应细胞杀伤功能
02

你需要提供

信息越清楚,方案越能贴着你的机制问题来设计;不齐也可以先聊,我们会一起补。

  • 靶点与机制假设 — 靶点、E3(如 CRBN)、预期的降解-功能链路,以及你最想回答的功能问题。
  • 化合物信息 — 结构或编号、纯度、溶解性、储存方式与建议浓度范围、对照分子。
  • 细胞与模型偏好 — 倾向的细胞系/原代来源、是否需要 2D/3D 或免疫细胞模型,以及已知的参考表型。
  • 已有数据 — 已确认的降解数据、活性窗口、毒性观察,方便我们设计浓度梯度与读出。
  • 读出优先级 — 先确认占有还是先看表型、是否需要原代/免疫功能,便于排定组合与节奏。
03

你会拿到

我们负责方案设计、降解读出与数据整合;涉及协作平台执行的条目会如实标注。

  • 功能与表型数据 — 活力/增殖/凋亡/周期等量化曲线与参数,必要时附高内涵成像结果。
  • 靶点占有与互作结果 — NanoBRET 占有曲线、PPI 或三元复合物验证,连接到结合-降解-功能链路。
  • 通路验证读出 — 报告基因/qPCR/通路蛋白与磷酸化结果,判断降解是否落到目标通路。
  • 原代/免疫功能数据 — 原代或免疫细胞的活化、细胞因子与增殖等读出,对分子胶与免疫炎症靶点尤为关键。
  • 整合解读与建议 — 把各读出串成一份连贯结论,指出下一步该补哪个实验或调整哪个变量。

想看清降解之后
到底发生了什么?

把你的靶点和机制问题告诉我们,一起挑出最该先做的功能与通路读出。